Coding

Part:BBa_K2043007

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Revision as of 20:21, 13 October 2016 by Macman (Talk | contribs)


bpuI laccase codon optimized for E. coli

bpuI codon optimized from Bacilus pumillus

Sequence and Features


Assembly Compatibility:
  • 10
    INCOMPATIBLE WITH RFC[10]
    Illegal PstI site found at 888
  • 12
    INCOMPATIBLE WITH RFC[12]
    Illegal PstI site found at 888
  • 21
    COMPATIBLE WITH RFC[21]
  • 23
    INCOMPATIBLE WITH RFC[23]
    Illegal PstI site found at 888
  • 25
    INCOMPATIBLE WITH RFC[25]
    Illegal PstI site found at 888
    Illegal AgeI site found at 52
    Illegal AgeI site found at 247
  • 1000
    COMPATIBLE WITH RFC[1000]


bpuI


                                                          .
                                                         1
                                                         1
                                                         1
                                                         M
                                                         M
                                                         M
                                                         M
                                                        \M/
                                                     . ' M ` .
                                                   \##-#####-##/
                                                    \# ##### #/
                                                  ###############
                                                  ###############
                                                   \ ! ! ! ! ! /
                                                    )! ! ! ! !(
                                                    +---------+
                                                    +! ! ! ! !+
                                                    +----*----+
                                                   +`. .':`. .'+
                                                   + .^. : .^. +
                                                   +:...:*:...:+
                                                   +`. .':`. .'+
                                                   + .^. : .^. +
                                                   +:...:*:...:+
                                                   +`. .':`. .'+
                                                   +. ^. : .^ .+
                                                  +:....:*:....:+
                                                  +` .  ':`  . '+
                                                  +  .^. : .^.  +
                                                  +:....:*:....:+
                                                  +` .. ':` .. '+
                                                  +. '` .:. '` .+
                                                  +:....:*:....:+
                                                  + `. .':`. .' +
                                                  +   X  :  X   +
                                                  +.'  `.:.'  `.+
                                                 +:......*......:+
                                                 +`.   .':`.   .'+
                                                 +   X   :   X   +
                                                 + .' `. : .' `. +
                                                 +.......*.......+
                                                 +` . . ':` . . '+
                                                 +   X   :   X   +
                                                 + '   ` : '   ` +
                                                 +../########....+
                                                 +`/#########\ .'+
                                                +  ############   +
                                                + '############`  +
                                                +:.......*.......:+
                                                + ` .  ' : `  . ' +
                                                +    X   :   X    +
                                                + .'   `.:.'   `. +
                                                +:.......*.......:+
                                                +`      ':`      '+
                                               +  `   '  :  `   '  +
                                               +    X   : :   X    +
                                               +  '   ` : : '   `  +
                                               +:.......*.*.......:+
                                               +`      ': :`      '+
                                               + `   '  : :  `   ' +
                                               +   X   : X :   X   +
                                              +  '   ` :' `: '   `  +
                                              +:.......*...*.......:+
                                              +`      ':` ':`      '+
                                              + `   '  : X :  `   ' +
                                              +   X   :     :   X   +
                                              + '   ` :/   \: '   ` +
                                             +:.......*.....*.......:+
                                             +`      ':`   ':`      '+
                                             + `   '  : `.' :  `   ' +
                                            +    X   :  ' `  :   X    +
                                            +  '   ` :'     `: '   `  +
                                            +:.......*.......*.......:+
                                           + `      ':`     ':`      ' +
                                           +  ` . '  :  `.'  :  ` . '  +
                                          +    ' `  :   ' `   :  ' `    +
                                          +. '    ` : '     ` : '    ` .+
                                         +..........*.........*..........+
                                         +  ###########################  +
                                         +  ###########################  +
                                        +   ###########################   +
                                     #########################################
                                    ###########################################
                                     \   1   1   1   1   1   1   1   1   1   /
                                      )  1   1   1   1   1   1   1   1   1  (
                                      +-----:-----+-------------+-----:-----+
                                      +     :     +             +     :     +
                                     *------*-----*-------------*-----*------*
                                     +XXXXXXXXXXX+XXXXXXXXXXXXXXX+XXXXXXXXXXX+
                                     *-----*-----*---------------*-----*-----*
                                    + `.   :  . '+               +` .  :   .' +
                                    +    . : '   +               +   ` : .    +
                                   +    . *.    +                 +    .* .    +
                                   + . '  : `.  +                 +  .' :  ` . +
                                  *:......*....:*                 *:....*......:*
                                  + `.   :   . '+                 +` .   :   .' +
                                 +     `.:. '  +                   +  ` .:.'     +
                                 +   . '* `.   +                   +   .' *` .   +
                                + . '   :    `.+                   +.'    :   ` . +
                                *:.....*.......*                   *.......*.....:*
                               +  ` .. :  .. ' +                   + ` ..  : .. '  +
                               +     . *'     +                     +     `* .     +
                              +  .. ' :   ` . +                     + . '   : ` ..  +
                              *.:....*.......:*                     *:.......*....:.*
                             +   ` ..: . - '  +                     +  ` - . :.. '   +
                             +    .. * ..    +                       +    .. * ..    +
                        -------------------------------------------------------------------
                          1 +:       :      +:       :       :       :+      :       :+ 1
                          1+ :       :      +:       :       :       :+      :       : +1
                        ###################################################################
                         1   1   1   1   1   1   1   1   1   1   1   1   1   1   1   1   1
                         1   1   1   1   1   1   1   1   1   1   1   1   1   1   1   1   1
                         +---------------------------------------------------------------+
                        +! . ! . ! . ! . !+. ! . ! . ! . ! . ! . ! . ! .+! . ! . ! . ! . !+
                       +:!: :!: :!: :!: :!+ :!: :!: :!: :!: :!: :!: :!: +!: :!: :!: :!: :!:+
                       +.!.:.!.:.!.:.!.:.!+:.!.:.!.:.!.:.!.:.!.:.!.:.!.:+!.:.!.:.!.:.!.:.!.+
                      +XXXXXXXXXXXXXXXXXX+\     \  ..-#######-..  /     /+XXXXXXXXXXXXXXXXXX+
                     *-------------------* \    .-' \  1 1 1  / `-.    / *-------------------*
                     +  ` .    : ..  '  +   \.-' \   .-------.   / `-./   +  `  .. :    . '  +
                    +.......:.*:........+ .-' \  .-''         ``-.  / `-. +........:*.:.......+
                   +    .  '  : ` .    +\:  \  -'                 `-  /  :/+    . ' :  `  .    +
                   +..:.......:.....:..+/ \ .-'                     `-. / \+..:.....:.......:..+
                  +    ` .   :    .  ' + \.'                           `./ + `  .    :   . '    +
                 +.........:.*..:.....+  /                               \  +.....:..*.:.........+
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