Difference between revisions of "Part:BBa K1602002"
Line 9: Line 9:
 
     </head>
 
     </head>
 
     <body>
 
     <body>
−
         <h1>Aconitate hydratase - acnA</h1>
+
         <h1>B0034 + yjhG</h1>
−
         <table>
+
         This composite represents the <small>D</small>-xylonic acid dehydratases yjhG plus the ribosomal binding site B0034.
−
            <colgroup width=50% span="2">
+
−
            <tr>
+
−
                <td>
+
−
                <b>acnA</b> is a gene, coding for a citrate-isomerase that occurs in <i>E.coli</i>(e.g.). It is a main part of the TCA-cycle and is responsible for the isomerization of citrate to cis-aconitate via isocitrate.
+
−
<!--<br>
+
−
                FUELLTEXT
+
−
                <br>
+
−
                <br>
+
−
-->
+
−
                </td>
+
−
                <td>
+
−
<div style="width: 300px; height: 300px; align: center; margin-left: 100px; margin-right:100px">
+
−
<video controls loop autoplay>
+
−
  <source src="https://static.igem.org/mediawiki/2015/e/e4/GltA_low_animated.mp4" type="video/mp4">
+
−
</video>
+
−
</div>
+
−
                </td>
+
−
            </tr>
+
−
            <tr>
+
−
                <td>
+
−
                    <!-- BLANK -->
+
−
                </td>
+
−
                <td>
+
−
                    <b>Figure 1</b> aconitate-isomerase (coded by acnA)
+
−
                </td>
+
−
            </tr>
+
−
            </colgroup>
+
−
        </table>
+
 
     </body>
 
     </body>
 
</html>
 
</html>
−
 
+
===<h2>Usage</h2>===
−
===<h2>Characteristics</h2>===
+
−
 
+
 
<html>
 
<html>
 
     <body>
 
     <body>
 +
        This part is a composite of one coding gene and a strong RBS (<a href="/Part:BBa_B0034">BBa_B0034</a>).
 +
        <br>
 
         <br>
 
         <br>
 
         <table>
 
         <table>
−
             <colgroup width=50% span="4">
+
             <colgroup width=33% span=3>
 
             <tr>
 
             <tr>
 
                 <td>
 
                 <td>
−
                     Molecular Weight
+
                     <ul>
 +
                        <li>yjhG</li>
 +
                        <li>RBS-B0034</li>
 +
                    </ul>
 
                 </td>
 
                 </td>
 
                 <td>
 
                 <td>
−
                     97677.22
+
                     <ul>
 +
                        <li><a href="https://parts.igem.org/Part:BBa_K1602012">BBa_K1602012</a></li>
 +
                        <li><a href="https://parts.igem.org/Part:BBa_B0034">BBa_B0034</a></li>
 +
                    </ul>
 
                 </td>
 
                 </td>
−
            </tr>
 
−
            <tr>
 
 
                 <td>
 
                 <td>
−
                     Residues
+
                     <div align="center" valign="middle"><img width="281" height="120" src="https://static.igem.org/mediawiki/2015/c/c1/Rbs_ cadA.png"></div>
−
                </td>
+
−
                <td>
+
−
                    891
+
−
                </td>
+
−
            </tr>
+
−
            <tr>
+
−
                <td>
+
−
                    Charge
+
−
                </td>
+
−
                <td>
+
−
                    -9.0
+
−
                </td>
+
−
            </tr>
+
−
            <tr>
+
−
                <td>
+
−
                    Isoelectric Point
+
−
                </td>
+
−
                <td>
+
−
                    109.627
+
−
                </td>
+
−
            </tr>
+
−
            <tr>
+
−
                <td>
+
−
                    A280 Molar Extinction Coefficients
+
−
                </td>
+
−
                <td>
+
−
                    114710 (reduced)  115085 (cystine bridges)
+
−
                </td>
+
−
            </tr>
+
−
            <tr>
+
−
                <td>
+
−
                    [Data taken from PEPSTATS]
+
 
                 </td>
 
                 </td>
 
             </tr>
 
             </tr>
 +
           
 
             </colgroup>
 
             </colgroup>
 
         </table>
 
         </table>
−
        <br>
+
    <br>
 +
    <br>
 +
   
 
     </body>
 
     </body>
 
</html>  
 
</html>  
  
 
===<h2>Sequence and Features</h2>===
 
===<h2>Sequence and Features</h2>===
−
<partinfo>BBa_K1602001 SequenceAndFeatures</partinfo>
+
<partinfo>BBa_K1602002 SequenceAndFeatures</partinfo>

Revision as of 13:56, 17 September 2015

B0034 + yjhG

This composite represents the D-xylonic acid dehydratases yjhG plus the ribosomal binding site B0034.

Usage

This part is a composite of one coding gene and a strong RBS (BBa_B0034).

  • yjhG
  • RBS-B0034


Sequence and Features


Assembly Compatibility:
  • 10
    COMPATIBLE WITH RFC[10]
  • 12
    COMPATIBLE WITH RFC[12]
  • 21
    INCOMPATIBLE WITH RFC[21]
    Illegal BamHI site found at 1016
  • 23
    COMPATIBLE WITH RFC[23]
  • 25
    INCOMPATIBLE WITH RFC[25]
    Illegal AgeI site found at 1921
  • 1000
    INCOMPATIBLE WITH RFC[1000]
    Illegal BsaI site found at 179