Difference between revisions of "Part:BBa K3734002"
 
(8 intermediate revisions by the same user not shown)
Line 1: Line 1:
 +
__NOTOC__
 +
<partinfo>BBa_K3734002 short</partinfo>
 +
 +
GIP is a promoter that can be induced by glucose. We first use it in 293T cell.
 +
 
<html>
 
<html>
  
 
<head>
 
<head>
−
     <meta charset="utf-8" />
+
      
−
    <meta name="viewport" content="width=device-width, initial-scale=1, shrink-to-fit=no" />
+
−
    <meta name="csu_china" content="csu_china" />
+
−
    <title>Team:csu_china</title>
+
−
    <!-- Favicon-->
+
−
    <link rel="icon" type="image/x-icon" href="assets/favicon.ico" />
+
−
    <!-- Font Awesome icons (free version)-->
+
−
    <script src="https://use.fontawesome.com/releases/v5.15.3/js/all.js" crossorigin="anonymous"></script>
+
−
    <!-- Google fonts-->
+
−
    <link href="https://fonts.googleapis.com/css?family=Montserrat:400,700" rel="stylesheet" type="text/css" />
+
−
    <link href="https://fonts.googleapis.com/css?family=Roboto+Slab:400,100,300,700" rel="stylesheet" type="text/css" />
+
−
    <!-- Core theme CSS (includes Bootstrap)-->
+
−
 
+
−
    <script src="http://code.jquery.com/jquery-latest.js"></script>
+
−
    <script src="https://2021.igem.org/wiki/index.php?title=Template:CSU_CHINA/JS/script&action=raw&ctype=text/javascript"></script>
+
−
    <script src="https://2021.igem.org/wiki/index.php?title=Template:CSU_CHINA/JS/scripts&action=raw&ctype=text/javascript"></script>
+
 
</head>
 
</head>
  
 
<body>
 
<body>
−
    <style>
+
              <h2 class="pageContent-main__title">
−
        .MathJax nobr>span.math>span {
+
−
            border-left-width: 0
+
−
        }
+
−
       
+
−
        ;
+
−
        html,
+
−
        body {
+
−
            font-family: 'Source Sans Pro', -apple-system, BlinkMacSystemFont, 'Segoe UI', Roboto, 'Helvetica Neue', Arial, sans-serif;
+
−
            font-size: 16px;
+
−
            word-spacing: 1px;
+
−
            -ms-text-size-adjust: 100%;
+
−
            -webkit-text-size-adjust: 100%;
+
−
            -moz-osx-font-smoothing: grayscale;
+
−
            -webkit-font-smoothing: antialiased;
+
−
            box-sizing: border-box;
+
−
            width: 100%;
+
−
            background-color: #fff;
+
−
            min-height: 100vh;
+
−
            padding: 0;
+
−
            margin: 0;
+
−
        }
+
−
       
+
−
        ::-webkit-scrollbar {
+
−
            display: none;
+
−
        }
+
−
       
+
−
        *,
+
−
        *:before,
+
−
        *:after {
+
−
            box-sizing: border-box;
+
−
            margin: 0;
+
−
        }
+
−
       
+
−
        :root {
+
−
            --primary: #074E9F;
+
−
            --primary-transparent: rgba(7, 78, 159, 0.5);
+
−
            --blue: #6DBFFF;
+
−
            --yellow: #FFC93C;
+
−
            --dark: #0d2b4d;
+
−
            --title-color: #004290;
+
−
            --text-color: #00244E;
+
−
        }
+
−
       
+
−
        #navbar {
+
−
            position: absolute;
+
−
            left: 0;
+
−
            top: 0;
+
−
            width: 100%;
+
−
            /* background-color:  */
+
−
            background: var(--primary-transparent);
+
−
            backdrop-filter: blur(8px);
+
−
            -webkit-backdrop-filter: blur(8px);
+
−
            transition: all .3s;
+
−
            z-index: 999;
+
−
        }
+
−
       
+
−
        #navbar>.logo {
+
−
            width: 100%;
+
−
            padding: .5rem 0 0 0;
+
−
            text-align: center;
+
−
        }
+
−
       
+
−
        #collapse {
+
−
            padding: 0 3%;
+
−
            display: flex;
+
−
            flex-direction: row;
+
−
            transition: all .3s;
+
−
        }
+
−
       
+
−
        #content {
+
−
            width: 100%;
+
−
            padding: 0;
+
−
            margin: 0;
+
−
        }
+
−
       
+
−
        #top_title {
+
−
            display: none;
+
−
        }
+
−
       
+
−
        #collapse>.navbar-list {
+
−
            flex-shrink: 0;
+
−
            padding: .5rem;
+
−
            display: flex;
+
−
            flex-shrink: 0;
+
−
            text-align: center;
+
−
            flex-direction: row;
+
−
            vertical-align: center;
+
−
            align-items: center;
+
−
            text-align: center;
+
−
            justify-content: center;
+
−
        }
+
−
       
+
−
        #collapse>.mainlist {
+
−
            flex: 1;
+
−
            /* overflow-y: hidden;
+
−
                overflow-x: auto; */
+
−
            /* overflow: auto; */
+
−
        }
+
−
       
+
−
        #collapse>.navbar-list>.navbar-list__item {
+
−
            font-size: .9rem;
+
−
            line-height: 1.5rem;
+
−
            color: #ffffff;
+
−
            font-weight: bold;
+
−
            padding: .3rem 1rem;
+
−
            /* flex: 1; */
+
−
            text-decoration: none;
+
−
            margin: 0 .3rem;
+
−
            font-family: San Francisco Display;
+
−
            transition: all .3s;
+
−
            border-radius: 2rem;
+
−
            position: relative;
+
−
            cursor: pointer;
+
−
        }
+
−
       
+
−
        #collapse>.navbar-list>.navbar-list__item:hover {
+
−
            overflow: visible;
+
−
        }
+
−
       
+
−
        #collapse>.navbar-list>.navbar-list__item .navbar-list__menu {
+
−
            position: absolute;
+
−
            top: 2.2rem;
+
−
            background-color: #ffffff;
+
−
            border-radius: 5px;
+
−
            box-shadow: 0 3px 10px -2px rgba(0, 0, 0, 0.1);
+
−
            width: 10rem;
+
−
            left: calc(50% - 5rem);
+
−
        }
+
−
       
+
−
        #collapse>.navbar-list>.navbar-list__item .navbar-list__menuItem {
+
−
            padding: .5rem 1rem;
+
−
            color: #333;
+
−
            display: block;
+
−
            text-decoration: none;
+
−
            cursor: pointer;
+
−
        }
+
−
       
+
−
        #collapse>.navbar-list>.active,
+
−
        #collapse>.navbar-list>.navbar-list__item:hover {
+
−
            background-color: var(--yellow);
+
−
            color: var(--primary);
+
−
        }
+
−
       
+
−
        #collapse>.navbar-list>.teamname {
+
−
            font-size: 1.5rem;
+
−
            color: var(--yellow);
+
−
        }
+
−
       
+
−
        #logo {
+
−
            width: 2.5rem;
+
−
            height: 2.5rem;
+
−
        }
+
−
       
+
−
        #home {
+
−
            width: 100%;
+
−
            min-height: 100vh;
+
−
            background-color: #ffffff;
+
−
            display: flex;
+
−
            flex-direction: column;
+
−
        }
+
−
       
+
−
        #home>.pageHead {
+
−
            height: 80vh;
+
−
            width: 100%;
+
−
            position: relative;
+
−
            background-position-y: top;
+
−
            background-position-x: center;
+
−
            background-size: cover;
+
−
            background-image: url('/static/images/lab.png');
+
−
            display: flex;
+
−
            flex-direction: column;
+
−
            justify-content: flex-end;
+
−
            z-index: 0;
+
−
        }
+
−
       
+
−
        #home>.pageHead::before {
+
−
            content: "";
+
−
            position: absolute;
+
−
            top: 0;
+
−
            left: 0;
+
−
            width: 100%;
+
−
            height: 80vh;
+
−
            background-color: rgba(0, 36, 78, .5);
+
−
            z-index: -1;
+
−
        }
+
−
       
+
−
        #home>.pageHead>.pageHead-content {
+
−
            text-align: center;
+
−
            display: flex;
+
−
            flex-direction: column;
+
−
        }
+
−
       
+
−
        #home>.pageHead>.pageHead-content>.pageHead-content__title {
+
−
            font-size: 5rem;
+
−
            color: #ffffff;
+
−
        }
+
−
       
+
−
        #home>.pageHead>.pageHead-content>.pageHead-content__description {
+
−
            margin: 6rem 10% 4rem 10%;
+
−
            font-size: 1rem;
+
−
            color: #ffffff;
+
−
        }
+
−
       
+
−
        #home>.pageContent {
+
−
            display: flex;
+
−
            flex-direction: row;
+
−
            min-height: 60vh;
+
−
        }
+
−
       
+
−
        #home>.pageContent>.pageContent-side {
+
−
            width: 20%;
+
−
            max-width: 200px;
+
−
            flex-shrink: 0;
+
−
        }
+
−
       
+
−
        #navlist {
+
−
            background-color: var(--dark);
+
−
            padding: 2rem .5rem 4rem .5rem;
+
−
            min-height: 55vh;
+
−
            border-bottom-right-radius: 2rem;
+
−
            position: relative;
+
−
            text-align: center;
+
−
            display: flex;
+
−
            flex-direction: column;
+
−
        }
+
−
       
+
−
        #navlist>.pageContent-navlist__head {
+
−
            padding: 1rem 0 1rem 0;
+
−
        }
+
−
       
+
−
        #navlist>.pageContent-navlist__head>.logo {
+
−
            margin: 1rem auto;
+
−
            width: 3.5rem;
+
−
            height: 3.5rem;
+
−
            border-radius: 50%;
+
−
            background-color: #dfdfdf;
+
−
        }
+
−
       
+
−
        #navlist>.pageContent-navlist__head>.title {
+
−
            color: #ffffff;
+
−
            font-size: 1.5rem;
+
−
            font-weight: bold;
+
−
        }
+
−
       
+
−
        #navlist>.pageContent-navlist__item {
+
−
            color: #ffffff;
+
−
            font-size: 1rem;
+
−
            padding: .6rem .1rem;
+
−
            margin: .1rem 0;
+
−
            text-align: center;
+
−
            width: 100%;
+
−
            transition: all .3s;
+
−
            text-decoration: none;
+
−
            border-radius: 3px;
+
−
            cursor: pointer;
+
−
        }
+
−
       
+
−
        #navlist>.pageContent-navlist__item:hover,
+
−
        #navlist>.active {
+
−
            background-color: var(--yellow);
+
−
            color: var(--dark);
+
−
        }
+
−
       
+
−
        #pagecontent {
+
−
            padding: 2rem 5%;
+
−
            position: relative;
+
−
            flex-shrink: 0;
+
−
            flex: 1;
+
−
            max-width: 70%;
+
−
        }
+
−
       
+
−
        #pagecontent .pageContent-main__title {
+
−
            font-size: 2rem;
+
−
            line-height: 2.5rem;
+
−
            color: var(--dark);
+
−
            position: relative;
+
−
            display: block;
+
−
            width: 95%;
+
−
            margin: 3rem auto 2rem auto;
+
−
        }
+
−
       
+
−
        #pagecontent .pageContent-main__subtitle {
+
−
            font-size: 1.5rem;
+
−
            line-height: 2.5rem;
+
−
            color: var(--dark);
+
−
            position: relative;
+
−
            display: block;
+
−
            width: 95%;
+
−
            margin: 3rem auto 2rem auto;
+
−
        }
+
−
       
+
−
        #pagecontent .pageContent-main__title::after {
+
−
            content: "";
+
−
            position: absolute;
+
−
            width: 100%;
+
−
            height: 3px;
+
−
            background-color: var(--dark);
+
−
            left: 0;
+
−
            bottom: -1rem;
+
−
        }
+
−
       
+
−
        #pagecontent .pageContent-main__textBox {
+
−
            width: 90%;
+
−
            margin: 1rem 5% 3rem 5%;
+
−
            color: var(--text-color);
+
−
            font-size: 1rem;
+
−
            line-height: 1.5rem;
+
−
        }
+
−
       
+
−
        #pagecontent .pageContent-main__textBox p {
+
−
            margin-bottom: 1.1rem;
+
−
            font-size: 1.1rem;
+
−
            line-height: 1.8rem;
+
−
        }
+
−
       
+
−
        #pagecontent .pageContent-main__textBox .name {
+
−
            font-weight: bold;
+
−
        }
+
−
       
+
−
        #pagecontent .pageContent-main__textBox .image {
+
−
            width: 80%;
+
−
            margin: 2rem 10%;
+
−
        }
+
−
       
+
−
        .pageContent-side .mytoc {
+
−
            position: -webkit-sticky;
+
−
            position: sticky;
+
−
            top: 12rem;
+
−
            background: transparent;
+
−
            padding: 1.5rem;
+
−
            border: none;
+
−
        }
+
−
       
+
−
        .pageContent-side .mytoc .toc_list {
+
−
            font-size: .8rem;
+
−
            color: #888;
+
−
            line-height: 1.5rem;
+
−
        }
+
−
       
+
−
        .pageContent-side .mytoc .toc_list .toclist__item a {
+
−
            color: #888;
+
−
            text-decoration: none;
+
−
        }
+
−
       
+
−
        .pageContent-side .mytoc .toc_list .toclist__item a:hover {
+
−
            color: var(--primary)
+
−
        }
+
−
       
+
−
        @media screen and (max-width: 800px) {
+
−
            #home>.screen>#group1>.title {
+
−
                width: 100%;
+
−
            }
+
−
            #navbar>.logo {
+
−
                padding: 0.5rem 0;
+
−
            }
+
−
            #collapse {
+
−
                height: 0;
+
−
            }
+
−
            #home>.pageContent>.pageContent-side {
+
−
                display: none;
+
−
            }
+
−
            #home>.screen>#group1 {
+
−
                padding-top: 5vh;
+
−
            }
+
−
            #home>.pageContent>.pageContent-main>.profilelist>.profile {
+
−
                width: calc(100% / 3)
+
−
            }
+
−
        }
+
−
    </style>
+
−
                <h2 class="pageContent-main__title">
+
 
                     <!--put tile here, <h2>title</h2>, class="pageContent-main__title" means it is the main title-->
 
                     <!--put tile here, <h2>title</h2>, class="pageContent-main__title" means it is the main title-->
 
                     GIP promoter
 
                     GIP promoter
Line 406: Line 26:
 
                 <div class="pageContent-main__textBox">
 
                 <div class="pageContent-main__textBox">
 
                     <!--all the content must included in this div-->
 
                     <!--all the content must included in this div-->
−
                     <img class="image" src="https://2021.igem.org/wiki/images/8/87/T--CSU_CHINA--tupian5.png">
+
                     <p style="text-align: center;">
 +
                        <img width="400px" src="https://2021.igem.org/wiki/images/8/87/T--CSU_CHINA--tupian5.png"></p>
 
                     <!--put image's url here-->
 
                     <!--put image's url here-->
 
                     <p style="width: 80%;text-align:center;font-size: .9rem; margin: -1rem auto 1rem auto; color: #888;">Fig.1 The model diagram of CHREBP-LUC</p>
 
                     <p style="width: 80%;text-align:center;font-size: .9rem; margin: -1rem auto 1rem auto; color: #888;">Fig.1 The model diagram of CHREBP-LUC</p>
Line 428: Line 49:
 
                     2.2 Result
 
                     2.2 Result
 
                 </h2>
 
                 </h2>
−
                 <div class="pageContent-main__textBox">
+
                 <p class="pageContent-main__textBox">
 
                     <!--all the content must included in this div-->
 
                     <!--all the content must included in this div-->
 
                     <p>GIP promoter is induced by glucose and the expression level rises along with the raise of glucose concentration.
 
                     <p>GIP promoter is induced by glucose and the expression level rises along with the raise of glucose concentration.
 
                     </p>
 
                     </p>
−
                     <img class="image" src="https://2021.igem.org/wiki/images/5/59/T--CSU_CHINA--tupian6.png">
+
                     <p style="text-align: center;">
 +
                        <img width="400px" src="https://2021.igem.org/wiki/images/5/59/T--CSU_CHINA--tupian6.png"></p>
 
                     <!--put image's url here-->
 
                     <!--put image's url here-->
 
                     <p style="width: 80%;text-align:center;font-size: .9rem; margin: -1rem auto 1rem auto; color: #888;">Fig.2 Changes of LUC expression over time after blue light irradiation with different glucose concentrations</p>
 
                     <p style="width: 80%;text-align:center;font-size: .9rem; margin: -1rem auto 1rem auto; color: #888;">Fig.2 Changes of LUC expression over time after blue light irradiation with different glucose concentrations</p>
 
                     <!--put text here, <p>content</p>-->
 
                     <!--put text here, <p>content</p>-->
−
                </div>
+
            </div>
−
                <h2 class="pageContent-main__title pageContent-main__subtitle">
+
            <h2 class="pageContent-main__title pageContent-main__subtitle">
−
                    <!--class="pageContent-main__title" means it is the sub title-->
+
                <!--class="pageContent-main__title" means it is the sub title-->
−
                    3.Caution
+
                3.Caution
−
                </h2>
+
            </h2>
−
                <div class="pageContent-main__textBox">
+
            <div class="pageContent-main__textBox">
−
                    <!--all the content must included in this div-->
+
                <!--all the content must included in this div-->
−
                    <p>Use medium without glucose when paving in case of the effect caused by glucose residue
+
                <p>Use medium without glucose when paving in case of the effect caused by glucose residue
−
                    </p>
+
                </p>
−
                </div>
+
            </div>
−
                <h2 class="pageContent-main__title pageContent-main__subtitle">
+
            <h2 class="pageContent-main__title pageContent-main__subtitle">
−
                    <!--class="pageContent-main__title" means it is the sub title-->
+
                <!--class="pageContent-main__title" means it is the sub title-->
−
                    Reference：
+
                Reference：
−
                </h2>
+
            </h2>
−
                <div class="pageContent-main__textBox">
+
            <div class="pageContent-main__textBox">
−
                    <!--all the content must included in this div-->
+
                <!--all the content must included in this div-->
−
                    <p>[1]Anthony T. Cheung,Bama Dayanandan,Jamie T. LewisGlucose-Dependent Insulin Release from Genetically Engineered K Cells[J].Science.2000,290:1959-1962
+
                <p>[1]Anthony T. Cheung,Bama Dayanandan,Jamie T. LewisGlucose-Dependent Insulin Release from Genetically Engineered K Cells[J].Science.2000,290:1959-1962
−
                    </p>
+
                </p>
−
                </div>
+
            </div>
 
</body>
 
</body>
 
</html>
 
</html>
 +
<!-- -->
 +
<span class='h3bb'>Sequence and Features</span>
 +
<partinfo>BBa_K3734002 SequenceAndFeatures</partinfo>
 +
 +
 +
<!-- Uncomment this to enable Functional Parameter display
 +
===Functional Parameters===
 +
<partinfo>BBa_K3734002 parameters</partinfo>
 +
<!-- -->

Latest revision as of 08:16, 21 October 2021

GIP promoter

GIP is a promoter that can be induced by glucose. We first use it in 293T cell.

GIP promoter

GIP promoter is anticipated in current literature that it can only be used in several certain types of cells like intestine cells, but we proved that it can function will in 293T cells which are usually used in labs.

1.Pattern diagram

Fig.1 The model diagram of CHREBP-LUC

2.Experiments

2.1 Method

We use LUC as report gene, test its real-time luminescence value at 560nm wavelength with specific devices and detect the expression level under different glucose concentration.

2.2 Result

GIP promoter is induced by glucose and the expression level rises along with the raise of glucose concentration.

Fig.2 Changes of LUC expression over time after blue light irradiation with different glucose concentrations

3.Caution

Use medium without glucose when paving in case of the effect caused by glucose residue

Reference：

[1]Anthony T. Cheung,Bama Dayanandan,Jamie T. LewisGlucose-Dependent Insulin Release from Genetically Engineered K Cells[J].Science.2000,290:1959-1962

Sequence and Features


Assembly Compatibility:
  • 10
    COMPATIBLE WITH RFC[10]
  • 12
    COMPATIBLE WITH RFC[12]
  • 21
    COMPATIBLE WITH RFC[21]
  • 23
    COMPATIBLE WITH RFC[23]
  • 25
    INCOMPATIBLE WITH RFC[25]
    Illegal NgoMIV site found at 899
  • 1000
    INCOMPATIBLE WITH RFC[1000]
    Illegal BsaI.rc site found at 216