Difference between revisions of "Part:BBa K1602001"
 
(4 intermediate revisions by 3 users not shown)
Line 9: Line 9:
 
     </head>
 
     </head>
 
     <body>
 
     <body>
−
         <h1>Citrate isomerase - gltA</h1>
+
         <h1>B0034-xylC</h1>
−
         <table>
+
         This composite represents the <small>D</small>-xylonolactone lactonase <i>xylC</i> plus the ribosomal binding site B0034.
−
            <colgroup width=50% span="2">
+
−
            <tr>
+
−
                <td>
+
−
                <b>gltA</b> is a gene, coding for a citrate synthase in <i>E.coli</i>. It is a main part of the TCA-cycle and is responsible for the synthesis of citrate by condensation of oxalacetate and Acetyl-CoA.  
+
−
<!--<br>
+
−
                FUELLTEXT
+
−
                <br>
+
−
                <br>
+
−
-->
+
−
                </td>
+
−
                <td>
+
−
                    <!--<div style="float: right;">-->
+
−
</div>
+
−
 
+
−
<div style="width: 300px; height: 300px; align: center; margin-left: 100px; margin-right:100px">
+
−
<video controls loop autoplay>
+
−
  <source src="https://static.igem.org/mediawiki/2015/6/6d/AcnA_animated_low.mp4" type="video/mp4">
+
−
</video>
+
−
</div>
+
−
 
+
−
<!--
+
−
                    <img style="width: 300px; height: 300px; align: center; margin-left: 100px; margin-right:100px" alt="" src="https://static.igem.org/mediawiki/2015/9/99/Acna_gif_animated.gif"> </div>
+
−
-->
+
−
<!--
+
−
<img style="width: 300px; height: 300px; align: center; margin-left: 100px; margin-right:100px" alt="" src="https://static.igem.org/mediawiki/2015/9/9a/Citrate_synthase_gltA.png">
+
−
</div>
+
−
-->
+
−
 
+
−
                </td>
+
−
            </tr>
+
−
            <tr>
+
−
                <td>
+
−
                    <!-- BLANK -->
+
−
                </td>
+
−
                <td>
+
−
                    <b>Figure 1</b> Citrate synthase (coded by gltA); represented in oligo state as a homo-hexameric protein unit
+
−
                </td>
+
−
            </tr>
+
−
            </colgroup>
+
−
        </table>
+
 
     </body>
 
     </body>
 
</html>
 
</html>
−
 
+
===<h2>Usage</h2>===
−
===<h2>Characteristics</h2>===
+
−
 
+
 
<html>
 
<html>
−
     <body>  
+
     <body>
 +
        This part is a composite of one coding gene and a strong RBS (<a href="/Part:BBa_B0034">BBa_B0034</a>).
 +
        <br>
 +
        <br>
 +
        We used this part for our <small>D</small>-xylonic acid producing operon <a href="https://parts.igem.org/Part:BBa_K1602017">(BBa_K1602017)</a>
 +
        <br>
 
         <br>
 
         <br>
 
         <table>
 
         <table>
−
             <colgroup width=50% span="4">
+
             <colgroup width=33% span=3>
 
             <tr>
 
             <tr>
 
                 <td>
 
                 <td>
−
                     Molecular Weight
+
                     <ul>
−
                 </td>
+
                        <li>xylC</li>
 +
                        <li>RBS-B0034</li>
 +
                    </ul>
 +
                 </td>  
 
                 <td>
 
                 <td>
−
                     48014,99
+
                     <ul>
 +
                        <li><a href="https://parts.igem.org/Part:BBa_K1602010">BBa_K1602010</a></li>
 +
                        <li><a href="https://parts.igem.org/Part:BBa_B0034">BBa_B0034</a></li>
 +
                    </ul>
 
                 </td>
 
                 </td>
−
            </tr>
 
−
            <tr>
 
 
                 <td>
 
                 <td>
−
                     Residues
+
                     <div align="center" valign="middle"><img class="transparent shrinkToFit" alt="https://static.igem.org/mediawiki/parts/5/5c/TU_Darmstadt_plasmid-card_B0034-xylC.png" src="https://static.igem.org/mediawiki/parts/5/5c/TU_Darmstadt_plasmid-card_B0034-xylC.png" height="227" width="255"></div>
−
                </td>
+
−
                <td>
+
−
                    427
+
−
                </td>
+
−
            </tr>
+
−
            <tr>
+
−
                <td>
+
−
                    Charge
+
−
                </td>
+
−
                <td>
+
−
                    1,5
+
−
                </td>
+
−
            </tr>
+
−
            <tr>
+
−
                <td>
+
−
                    Isoelectric Point
+
−
                </td>
+
−
                <td>
+
−
                    6,6751
+
−
                </td>
+
−
            </tr>
+
−
            <tr>
+
−
                <td>
+
−
                    A280 Molar Extinction Coefficients
+
−
                </td>
+
−
                <td>
+
−
                    40340 (reduced)  40715 (cystine bridges)
+
−
                </td>
+
−
            </tr>
+
−
            <tr>
+
−
                <td>
+
−
                    [Data taken from PEPSTATS]
+
 
                 </td>
 
                 </td>
 
             </tr>
 
             </tr>
 +
           
 
             </colgroup>
 
             </colgroup>
 
         </table>
 
         </table>
−
        <br>
+
    <br>
 +
    <br>
 +
   
 
     </body>
 
     </body>
 
</html>  
 
</html>  

Latest revision as of 21:47, 18 September 2015

B0034-xylC

This composite represents the D-xylonolactone lactonase xylC plus the ribosomal binding site B0034.

Usage

This part is a composite of one coding gene and a strong RBS (BBa_B0034).

We used this part for our D-xylonic acid producing operon (BBa_K1602017)

  • xylC
  • RBS-B0034
https://static.igem.org/mediawiki/parts/5/5c/TU_Darmstadt_plasmid-card_B0034-xylC.png


Sequence and Features


Assembly Compatibility:
  • 10
    COMPATIBLE WITH RFC[10]
  • 12
    COMPATIBLE WITH RFC[12]
  • 21
    COMPATIBLE WITH RFC[21]
  • 23
    COMPATIBLE WITH RFC[23]
  • 25
    COMPATIBLE WITH RFC[25]
  • 1000
    COMPATIBLE WITH RFC[1000]