Difference between revisions of "Part:BBa K1602001"
 
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     </head>
 
     </head>
 
     <body>
 
     <body>
−
         <h1>Citrate synthase - gltA</h1>
+
         <h1>B0034-xylC</h1>
−
         <table>
+
         This composite represents the <small>D</small>-xylonolactone lactonase <i>xylC</i> plus the ribosomal binding site B0034.
−
            <colgroup width=50% span="2">
+
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            <tr>
+
−
                <td>
+
−
                <b>gltA</b> is a gene, coding for a citrate synthase in <i>E.coli</i>. Lorem ipsum dolor sit amet, consetetur sadipscing elitr, sed diam nonumy eirmod tempor invidunt ut labore et dolore magna aliquyam erat, sed diam voluptua. At vero eos et accusam et justo duo dolores et ea rebum. Stet clita kasd gubergren, no sea takimata sanctus est Lorem ipsum dolor sit amet.
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<!--<br>
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                FUELLTEXT
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                <br>
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                <br>
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−
-->
+
−
                </td>
+
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                <td>
+
−
                    <!--<div style="float: right;">-->
+
−
                    <img style="width: 300px; height: 300px; align: center; margin-left: 100px; margin-right:100px" alt="" src="img/citrate_synthase_gltA.png"> </div>
+
−
<!--
+
−
<div style="float: right;"><img style="width: 400px; height: 120px;" alt="" src="
+
−
https://static.igem.org/mediawiki/2015/a/a1/Itaconic_acid_gene_operon.png"> </div>
+
−
-->
+
−
                </td>
+
−
            </tr>
+
−
            <tr>
+
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                <td>
+
−
                    <!-- BLANK -->
+
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                </td>
+
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                <td>
+
−
                    <b>Figure 1</b> Citrate synthase (coded by gltA); represented in oligo state as a homo-hexameric protein unit
+
−
                </td>
+
−
            </tr>
+
−
            </colgroup>
+
−
        </table>
+
 
     </body>
 
     </body>
 
</html>
 
</html>
−
 
+
===<h2>Usage</h2>===
−
===<h2>Characteristics</h2>===
+
−
 
+
 
<html>
 
<html>
−
     <body>  
+
     <body>
 +
        This part is a composite of one coding gene and a strong RBS (<a href="/Part:BBa_B0034">BBa_B0034</a>).
 
         <br>
 
         <br>
 +
        <br>
 +
        We used this part for our <small>D</small>-xylonic acid producing operon <a href="https://parts.igem.org/Part:BBa_K1602017">(BBa_K1602017)</a>
 
         <br>
 
         <br>
 
         <br>
 
         <br>
 
         <table>
 
         <table>
−
             <colgroup width=50% span="4">
+
             <colgroup width=33% span=3>
 
             <tr>
 
             <tr>
 
                 <td>
 
                 <td>
−
                     Molecular Weight
+
                     <ul>
−
                 </td>
+
                        <li>xylC</li>
 +
                        <li>RBS-B0034</li>
 +
                    </ul>
 +
                 </td>  
 
                 <td>
 
                 <td>
−
                     48014,99
+
                     <ul>
 +
                        <li><a href="https://parts.igem.org/Part:BBa_K1602010">BBa_K1602010</a></li>
 +
                        <li><a href="https://parts.igem.org/Part:BBa_B0034">BBa_B0034</a></li>
 +
                    </ul>
 
                 </td>
 
                 </td>
−
            </tr>
 
−
            <tr>
 
 
                 <td>
 
                 <td>
−
                     Residues
+
                     <div align="center" valign="middle"><img class="transparent shrinkToFit" alt="https://static.igem.org/mediawiki/parts/5/5c/TU_Darmstadt_plasmid-card_B0034-xylC.png" src="https://static.igem.org/mediawiki/parts/5/5c/TU_Darmstadt_plasmid-card_B0034-xylC.png" height="227" width="255"></div>
−
                </td>
+
−
                <td>
+
−
                    427
+
−
                </td>
+
−
            </tr>
+
−
            <tr>
+
−
                <td>
+
−
                    Charge
+
−
                </td>
+
−
                <td>
+
−
                    1,5
+
−
                </td>
+
−
            </tr>
+
−
            <tr>
+
−
                <td>
+
−
                    Isoelectric Point
+
−
                </td>
+
−
                <td>
+
−
                    6,6751
+
−
                </td>
+
−
            </tr>
+
−
            <tr>
+
−
                <td>
+
−
                    A280 Molar Extinction Coefficients
+
−
                </td>
+
−
                <td>
+
−
                    40340 (reduced)  40715 (cystine bridges)
+
−
                </td>
+
−
            </tr>
+
−
            <tr>
+
−
                <td>
+
−
                    [Data taken from PEPSTATS]
+
 
                 </td>
 
                 </td>
 
             </tr>
 
             </tr>
 +
           
 
             </colgroup>
 
             </colgroup>
 
         </table>
 
         </table>
−
        <br>
+
    <br>
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        <br>
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    <br>
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        <br>
+
   
 
     </body>
 
     </body>
 
</html>  
 
</html>  

Latest revision as of 21:47, 18 September 2015

B0034-xylC

This composite represents the D-xylonolactone lactonase xylC plus the ribosomal binding site B0034.

Usage

This part is a composite of one coding gene and a strong RBS (BBa_B0034).

We used this part for our D-xylonic acid producing operon (BBa_K1602017)

  • xylC
  • RBS-B0034
https://static.igem.org/mediawiki/parts/5/5c/TU_Darmstadt_plasmid-card_B0034-xylC.png


Sequence and Features


Assembly Compatibility:
  • 10
    COMPATIBLE WITH RFC[10]
  • 12
    COMPATIBLE WITH RFC[12]
  • 21
    COMPATIBLE WITH RFC[21]
  • 23
    COMPATIBLE WITH RFC[23]
  • 25
    COMPATIBLE WITH RFC[25]
  • 1000
    COMPATIBLE WITH RFC[1000]