Difference between revisions of "Part:BBa K3734006"

 
(4 intermediate revisions by the same user not shown)
Line 1: Line 1:
 
 
__NOTOC__
 
__NOTOC__
 
<partinfo>BBa_K3734006 short</partinfo>
 
<partinfo>BBa_K3734006 short</partinfo>
Line 7: Line 6:
  
 
<head>
 
<head>
     <meta charset="utf-8" />
+
      
    <meta name="viewport" content="width=device-width, initial-scale=1, shrink-to-fit=no" />
+
    <meta name="csu_china" content="csu_china" />
+
    <title>Team:csu_china</title>
+
    <!-- Favicon-->
+
    <link rel="icon" type="image/x-icon" href="assets/favicon.ico" />
+
    <!-- Font Awesome icons (free version)-->
+
    <script src="https://use.fontawesome.com/releases/v5.15.3/js/all.js" crossorigin="anonymous"></script>
+
    <!-- Google fonts-->
+
    <link href="https://fonts.googleapis.com/css?family=Montserrat:400,700" rel="stylesheet" type="text/css" />
+
    <link href="https://fonts.googleapis.com/css?family=Roboto+Slab:400,100,300,700" rel="stylesheet" type="text/css" />
+
    <!-- Core theme CSS (includes Bootstrap)-->
+
 
+
    <script src="http://code.jquery.com/jquery-latest.js"></script>
+
    <script src="https://2021.igem.org/wiki/index.php?title=Template:CSU_CHINA/JS/script&action=raw&ctype=text/javascript"></script>
+
    <script src="https://2021.igem.org/wiki/index.php?title=Template:CSU_CHINA/JS/scripts&action=raw&ctype=text/javascript"></script>
+
 
</head>
 
</head>
  
 
<body>
 
<body>
    <style>
+
<h2 class="pageContent-main__title"><!--put tile here, <h2>title</h2>, class="pageContent-main__title" means it is the main title-->
        .MathJax nobr>span.math>span {
+
            border-left-width: 0
+
        }
+
       
+
        ;
+
        html,
+
        body {
+
            font-family: 'Source Sans Pro', -apple-system, BlinkMacSystemFont, 'Segoe UI', Roboto, 'Helvetica Neue', Arial, sans-serif;
+
            font-size: 16px;
+
            word-spacing: 1px;
+
            -ms-text-size-adjust: 100%;
+
            -webkit-text-size-adjust: 100%;
+
            -moz-osx-font-smoothing: grayscale;
+
            -webkit-font-smoothing: antialiased;
+
            box-sizing: border-box;
+
            width: 100%;
+
            background-color: #fff;
+
            min-height: 100vh;
+
            padding: 0;
+
            margin: 0;
+
        }
+
       
+
        ::-webkit-scrollbar {
+
            display: none;
+
        }
+
       
+
        *,
+
        *:before,
+
        *:after {
+
            box-sizing: border-box;
+
            margin: 0;
+
        }
+
       
+
        :root {
+
            --primary: #074E9F;
+
            --primary-transparent: rgba(7, 78, 159, 0.5);
+
            --blue: #6DBFFF;
+
            --yellow: #FFC93C;
+
            --dark: #0d2b4d;
+
            --title-color: #004290;
+
            --text-color: #00244E;
+
        }
+
       
+
        #navbar {
+
            position: absolute;
+
            left: 0;
+
            top: 0;
+
            width: 100%;
+
            /* background-color:  */
+
            background: var(--primary-transparent);
+
            backdrop-filter: blur(8px);
+
            -webkit-backdrop-filter: blur(8px);
+
            transition: all .3s;
+
            z-index: 999;
+
        }
+
       
+
        #navbar>.logo {
+
            width: 100%;
+
            padding: .5rem 0 0 0;
+
            text-align: center;
+
        }
+
       
+
        #collapse {
+
            padding: 0 3%;
+
            display: flex;
+
            flex-direction: row;
+
            transition: all .3s;
+
        }
+
       
+
        #content {
+
            width: 100%;
+
            padding: 0;
+
            margin: 0;
+
        }
+
       
+
        #top_title {
+
            display: none;
+
        }
+
       
+
        #collapse>.navbar-list {
+
            flex-shrink: 0;
+
            padding: .5rem;
+
            display: flex;
+
            flex-shrink: 0;
+
            text-align: center;
+
            flex-direction: row;
+
            vertical-align: center;
+
            align-items: center;
+
            text-align: center;
+
            justify-content: center;
+
        }
+
       
+
        #collapse>.mainlist {
+
            flex: 1;
+
            /* overflow-y: hidden;
+
                overflow-x: auto; */
+
            /* overflow: auto; */
+
        }
+
       
+
        #collapse>.navbar-list>.navbar-list__item {
+
            font-size: .9rem;
+
            line-height: 1.5rem;
+
            color: #ffffff;
+
            font-weight: bold;
+
            padding: .3rem 1rem;
+
            /* flex: 1; */
+
            text-decoration: none;
+
            margin: 0 .3rem;
+
            font-family: San Francisco Display;
+
            transition: all .3s;
+
            border-radius: 2rem;
+
            position: relative;
+
            cursor: pointer;
+
        }
+
       
+
        #collapse>.navbar-list>.navbar-list__item:hover {
+
            overflow: visible;
+
        }
+
       
+
        #collapse>.navbar-list>.navbar-list__item .navbar-list__menu {
+
            position: absolute;
+
            top: 2.2rem;
+
            background-color: #ffffff;
+
            border-radius: 5px;
+
            box-shadow: 0 3px 10px -2px rgba(0, 0, 0, 0.1);
+
            width: 10rem;
+
            left: calc(50% - 5rem);
+
        }
+
       
+
        #collapse>.navbar-list>.navbar-list__item .navbar-list__menuItem {
+
            padding: .5rem 1rem;
+
            color: #333;
+
            display: block;
+
            text-decoration: none;
+
            cursor: pointer;
+
        }
+
       
+
        #collapse>.navbar-list>.active,
+
        #collapse>.navbar-list>.navbar-list__item:hover {
+
            background-color: var(--yellow);
+
            color: var(--primary);
+
        }
+
       
+
        #collapse>.navbar-list>.teamname {
+
            font-size: 1.5rem;
+
            color: var(--yellow);
+
        }
+
       
+
        #logo {
+
            width: 2.5rem;
+
            height: 2.5rem;
+
        }
+
       
+
        #home {
+
            width: 100%;
+
            min-height: 100vh;
+
            background-color: #ffffff;
+
            display: flex;
+
            flex-direction: column;
+
        }
+
       
+
        #home>.pageHead {
+
            height: 80vh;
+
            width: 100%;
+
            position: relative;
+
            background-position-y: top;
+
            background-position-x: center;
+
            background-size: cover;
+
            background-image: url('/static/images/lab.png');
+
            display: flex;
+
            flex-direction: column;
+
            justify-content: flex-end;
+
            z-index: 0;
+
        }
+
       
+
        #home>.pageHead::before {
+
            content: "";
+
            position: absolute;
+
            top: 0;
+
            left: 0;
+
            width: 100%;
+
            height: 80vh;
+
            background-color: rgba(0, 36, 78, .5);
+
            z-index: -1;
+
        }
+
       
+
        #home>.pageHead>.pageHead-content {
+
            text-align: center;
+
            display: flex;
+
            flex-direction: column;
+
        }
+
       
+
        #home>.pageHead>.pageHead-content>.pageHead-content__title {
+
            font-size: 5rem;
+
            color: #ffffff;
+
        }
+
       
+
        #home>.pageHead>.pageHead-content>.pageHead-content__description {
+
            margin: 6rem 10% 4rem 10%;
+
            font-size: 1rem;
+
            color: #ffffff;
+
        }
+
       
+
        #home>.pageContent {
+
            display: flex;
+
            flex-direction: row;
+
            min-height: 60vh;
+
        }
+
       
+
        #home>.pageContent>.pageContent-side {
+
            width: 20%;
+
            max-width: 200px;
+
            flex-shrink: 0;
+
        }
+
       
+
        #navlist {
+
            background-color: var(--dark);
+
            padding: 2rem .5rem 4rem .5rem;
+
            min-height: 55vh;
+
            border-bottom-right-radius: 2rem;
+
            position: relative;
+
            text-align: center;
+
            display: flex;
+
            flex-direction: column;
+
        }
+
       
+
        #navlist>.pageContent-navlist__head {
+
            padding: 1rem 0 1rem 0;
+
        }
+
       
+
        #navlist>.pageContent-navlist__head>.logo {
+
            margin: 1rem auto;
+
            width: 3.5rem;
+
            height: 3.5rem;
+
            border-radius: 50%;
+
            background-color: #dfdfdf;
+
        }
+
       
+
        #navlist>.pageContent-navlist__head>.title {
+
            color: #ffffff;
+
            font-size: 1.5rem;
+
            font-weight: bold;
+
        }
+
       
+
        #navlist>.pageContent-navlist__item {
+
            color: #ffffff;
+
            font-size: 1rem;
+
            padding: .6rem .1rem;
+
            margin: .1rem 0;
+
            text-align: center;
+
            width: 100%;
+
            transition: all .3s;
+
            text-decoration: none;
+
            border-radius: 3px;
+
            cursor: pointer;
+
        }
+
       
+
        #navlist>.pageContent-navlist__item:hover,
+
        #navlist>.active {
+
            background-color: var(--yellow);
+
            color: var(--dark);
+
        }
+
       
+
        #pagecontent {
+
            padding: 2rem 5%;
+
            position: relative;
+
            flex-shrink: 0;
+
            flex: 1;
+
            max-width: 70%;
+
        }
+
       
+
        #pagecontent .pageContent-main__title {
+
            font-size: 2rem;
+
            line-height: 2.5rem;
+
            color: var(--dark);
+
            position: relative;
+
            display: block;
+
            width: 95%;
+
            margin: 3rem auto 2rem auto;
+
        }
+
       
+
        #pagecontent .pageContent-main__subtitle {
+
            font-size: 1.5rem;
+
            line-height: 2.5rem;
+
            color: var(--dark);
+
            position: relative;
+
            display: block;
+
            width: 95%;
+
            margin: 3rem auto 2rem auto;
+
        }
+
       
+
        #pagecontent .pageContent-main__title::after {
+
            content: "";
+
            position: absolute;
+
            width: 100%;
+
            height: 3px;
+
            background-color: var(--dark);
+
            left: 0;
+
            bottom: -1rem;
+
        }
+
       
+
        #pagecontent .pageContent-main__textBox {
+
            width: 90%;
+
            margin: 1rem 5% 3rem 5%;
+
            color: var(--text-color);
+
            font-size: 1rem;
+
            line-height: 1.5rem;
+
        }
+
       
+
        #pagecontent .pageContent-main__textBox p {
+
            margin-bottom: 1.1rem;
+
            font-size: 1.1rem;
+
            line-height: 1.8rem;
+
        }
+
       
+
        #pagecontent .pageContent-main__textBox .name {
+
            font-weight: bold;
+
        }
+
       
+
        #pagecontent .pageContent-main__textBox .image {
+
            width: 80%;
+
            margin: 2rem 10%;
+
        }
+
       
+
        .pageContent-side .mytoc {
+
            position: -webkit-sticky;
+
            position: sticky;
+
            top: 12rem;
+
            background: transparent;
+
            padding: 1.5rem;
+
            border: none;
+
        }
+
       
+
        .pageContent-side .mytoc .toc_list {
+
            font-size: .8rem;
+
            color: #888;
+
            line-height: 1.5rem;
+
        }
+
       
+
        .pageContent-side .mytoc .toc_list .toclist__item a {
+
            color: #888;
+
            text-decoration: none;
+
        }
+
       
+
        .pageContent-side .mytoc .toc_list .toclist__item a:hover {
+
            color: var(--primary)
+
        }
+
       
+
        @media screen and (max-width: 800px) {
+
            #home>.screen>#group1>.title {
+
                width: 100%;
+
            }
+
            #navbar>.logo {
+
                padding: 0.5rem 0;
+
            }
+
            #collapse {
+
                height: 0;
+
            }
+
            #home>.pageContent>.pageContent-side {
+
                display: none;
+
            }
+
            #home>.screen>#group1 {
+
                padding-top: 5vh;
+
            }
+
            #home>.pageContent>.pageContent-main>.profilelist>.profile {
+
                width: calc(100% / 3)
+
            }
+
        }
+
    </style>
+
              <h2 class="pageContent-main__title">
+
                <!--put tile here, <h2>title</h2>, class="pageContent-main__title" means it is the main title-->
+
 
                 LOV
 
                 LOV
 
             </h2>
 
             </h2>
Line 411: Line 24:
 
             <div class="pageContent-main__textBox">
 
             <div class="pageContent-main__textBox">
 
                 <!--all the content must included in this div-->
 
                 <!--all the content must included in this div-->
                 <img class="image" src="https://2021.igem.org/wiki/images/f/f3/T--CSU_CHINA--tupian8.png">
+
                 <p style="text-align: center;">
 +
                    <img width="400px" src="https://2021.igem.org/wiki/images/f/f3/T--CSU_CHINA--tupian8.png"></p>
 
                 <!--put image's url here-->
 
                 <!--put image's url here-->
 
                 <p style="width: 80%;text-align:center;font-size: .9rem; margin: -1rem auto 1rem auto; color: #888;">Fig.1 The model diagram of LOV-VP16</p>
 
                 <p style="width: 80%;text-align:center;font-size: .9rem; margin: -1rem auto 1rem auto; color: #888;">Fig.1 The model diagram of LOV-VP16</p>
Line 434: Line 48:
 
                 </p>
 
                 </p>
 
             </div>
 
             </div>
<body>
+
</body>
<html>
+
</html>
 +
 
 
<!-- Add more about the biology of this part here
 
<!-- Add more about the biology of this part here
 
===Usage and Biology===
 
===Usage and Biology===
Line 442: Line 57:
 
<span class='h3bb'>Sequence and Features</span>
 
<span class='h3bb'>Sequence and Features</span>
 
<partinfo>BBa_K3734006 SequenceAndFeatures</partinfo>
 
<partinfo>BBa_K3734006 SequenceAndFeatures</partinfo>
 
  
 
<!-- Uncomment this to enable Functional Parameter display  
 
<!-- Uncomment this to enable Functional Parameter display  

Latest revision as of 08:37, 20 October 2021

LOV

LOV is a kind of light-activated protein. If you shine blue light on it, it will change its own structure and will be able to combined with GI.

LOV

LOV is a photosensitive protein, the structure will alter under 450nm blue light exposure and form a dimer with GI. We used LOV as a part of our blue light switch.

1.Pattern diagram

Fig.1 The model diagram of LOV-VP16

2.Caution

The duration of the combination of GI and LOV after the blue light exposure will alter as the illuminate method and the intensity of the blue light differ. We used strong light for a 30min exposure and then use weak light for another 30min exposure.

Reference:

[1]Masayuki Yazawa , Amir M Sadaghiani, Brian Hsueh.Induction of protein-protein interactions in live cells using light[J].Nat Biotechnol. 2009 Oct;27(10):941-5.

Sequence and Features


Assembly Compatibility:
  • 10
    COMPATIBLE WITH RFC[10]
  • 12
    COMPATIBLE WITH RFC[12]
  • 21
    INCOMPATIBLE WITH RFC[21]
    Illegal XhoI site found at 293
  • 23
    COMPATIBLE WITH RFC[23]
  • 25
    COMPATIBLE WITH RFC[25]
  • 1000
    COMPATIBLE WITH RFC[1000]