Difference between revisions of "Part:BBa K2043007"

 
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<partinfo>BBa_K2043007 parameters</partinfo>
 
<partinfo>BBa_K2043007 parameters</partinfo>
 
<!-- -->
 
<!-- -->
 +
 +
<h1>bpuI</h1>
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 +
<pre>
 +
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                                                          .
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                                                        1
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                                                        1
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                                                        M
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                                                        M
 +
                                                        M
 +
                                                        M
 +
                                                        \M/
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                                                    . ' M ` .
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                                                  \##-#####-##/
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                                                    \# ##### #/
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                                                  ###############
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                                                  ###############
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                                                  \ ! ! ! ! ! /
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                                                    )! ! ! ! !(
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                                                    +---------+
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                                                    +! ! ! ! !+
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                                                    +----*----+
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                                                  +`. .':`. .'+
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                                                  + .^. : .^. +
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                                                  +:...:*:...:+
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                                                  +`. .':`. .'+
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                                                  + .^. : .^. +
 +
                                                  +:...:*:...:+
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                                                  +`. .':`. .'+
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                                                  +. ^. : .^ .+
 +
                                                  +:....:*:....:+
 +
                                                  +` .  ':`  . '+
 +
                                                  +  .^. : .^.  +
 +
                                                  +:....:*:....:+
 +
                                                  +` .. ':` .. '+
 +
                                                  +. '` .:. '` .+
 +
                                                  +:....:*:....:+
 +
                                                  + `. .':`. .' +
 +
                                                  +  X  :  X  +
 +
                                                  +.'  `.:.'  `.+
 +
                                                +:......*......:+
 +
                                                +`.  .':`.  .'+
 +
                                                +  X  :  X  +
 +
                                                + .' `. : .' `. +
 +
                                                +.......*.......+
 +
                                                +` . . ':` . . '+
 +
                                                +  X  :  X  +
 +
                                                + '  ` : '  ` +
 +
                                                +../########....+
 +
                                                +`/#########\ .'+
 +
                                                +  ############  +
 +
                                                + '############`  +
 +
                                                +:.......*.......:+
 +
                                                + ` .  ' : `  . ' +
 +
                                                +    X  :  X    +
 +
                                                + .'  `.:.'  `. +
 +
                                                +:.......*.......:+
 +
                                                +`      ':`      '+
 +
                                              +  `  '  :  `  '  +
 +
                                              +    X  : :  X    +
 +
                                              +  '  ` : : '  `  +
 +
                                              +:.......*.*.......:+
 +
                                              +`      ': :`      '+
 +
                                              + `  '  : :  `  ' +
 +
                                              +  X  : X :  X  +
 +
                                              +  '  ` :' `: '  `  +
 +
                                              +:.......*...*.......:+
 +
                                              +`      ':` ':`      '+
 +
                                              + `  '  : X :  `  ' +
 +
                                              +  X  :    :  X  +
 +
                                              + '  ` :/  \: '  ` +
 +
                                            +:.......*.....*.......:+
 +
                                            +`      ':`  ':`      '+
 +
                                            + `  '  : `.' :  `  ' +
 +
                                            +    X  :  ' `  :  X    +
 +
                                            +  '  ` :'    `: '  `  +
 +
                                            +:.......*.......*.......:+
 +
                                          + `      ':`    ':`      ' +
 +
                                          +  ` . '  :  `.'  :  ` . '  +
 +
                                          +    ' `  :  ' `  :  ' `    +
 +
                                          +. '    ` : '    ` : '    ` .+
 +
                                        +..........*.........*..........+
 +
                                        +  ###########################  +
 +
                                        +  ###########################  +
 +
                                        +  ###########################  +
 +
                                    #########################################
 +
                                    ###########################################
 +
                                    \  1  1  1  1  1  1  1  1  1  /
 +
                                      )  1  1  1  1  1  1  1  1  1  (
 +
                                      +-----:-----+-------------+-----:-----+
 +
                                      +    :    +            +    :    +
 +
                                    *------*-----*-------------*-----*------*
 +
                                    +XXXXXXXXXXX+XXXXXXXXXXXXXXX+XXXXXXXXXXX+
 +
                                    *-----*-----*---------------*-----*-----*
 +
                                    + `.  :  . '+              +` .  :  .' +
 +
                                    +    . : '  +              +  ` : .    +
 +
                                  +    . *.    +                +    .* .    +
 +
                                  + . '  : `.  +                +  .' :  ` . +
 +
                                  *:......*....:*                *:....*......:*
 +
                                  + `.  :  . '+                +` .  :  .' +
 +
                                +    `.:. '  +                  +  ` .:.'    +
 +
                                +  . '* `.  +                  +  .' *` .  +
 +
                                + . '  :    `.+                  +.'    :  ` . +
 +
                                *:.....*.......*                  *.......*.....:*
 +
                              +  ` .. :  .. ' +                  + ` ..  : .. '  +
 +
                              +    . *'    +                    +    `* .    +
 +
                              +  .. ' :  ` . +                    + . '  : ` ..  +
 +
                              *.:....*.......:*                    *:.......*....:.*
 +
                            +  ` ..: . - '  +                    +  ` - . :.. '  +
 +
                            +    .. * ..    +                      +    .. * ..    +
 +
                        -------------------------------------------------------------------
 +
                          1 +:      :      +:      :      :      :+      :      :+ 1
 +
                          1+ :      :      +:      :      :      :+      :      : +1
 +
                        ###################################################################
 +
                        1  1  1  1  1  1  1  1  1  1  1  1  1  1  1  1  1
 +
                        1  1  1  1  1  1  1  1  1  1  1  1  1  1  1  1  1
 +
                        +---------------------------------------------------------------+
 +
                        +! . ! . ! . ! . !+. ! . ! . ! . ! . ! . ! . ! .+! . ! . ! . ! . !+
 +
                      +:!: :!: :!: :!: :!+ :!: :!: :!: :!: :!: :!: :!: +!: :!: :!: :!: :!:+
 +
                      +.!.:.!.:.!.:.!.:.!+:.!.:.!.:.!.:.!.:.!.:.!.:.!.:+!.:.!.:.!.:.!.:.!.+
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                      +XXXXXXXXXXXXXXXXXX+\    \  ..-#######-..  /    /+XXXXXXXXXXXXXXXXXX+
 +
                    *-------------------* \    .-' \  1 1 1  / `-.    / *-------------------*
 +
                    +  ` .    : ..  '  +  \.-' \  .-------.  / `-./  +  `  .. :    . '  +
 +
                    +.......:.*:........+ .-' \  .-''        ``-.  / `-. +........:*.:.......+
 +
                  +    .  '  : ` .    +\:  \  -'                `-  /  :/+    . ' :  `  .    +
 +
                  +..:.......:.....:..+/ \ .-'                    `-. / \+..:.....:.......:..+
 +
                  +    ` .  :    .  ' + \.'                          `./ + `  .    :  . '    +
 +
                +.........:.*..:.....+  /                              \  +.....:..*.:.........+
 +
                +    .  '  :  ` .  + /                                \ +  . '  :  `  .    +
 +
                +...:......:........:+ /                                  \ +:........:..........+
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              +    `  .  :  .  '    +/                                    \+    `  .  :  .  '    +
 +
              +...........*.........+                                        +.........*...........+
 +
            +    .  '  :  `  .  +                                        +  .  '  :  `  .    +
 +
            +...:.......:.........:+                                          +:.........:.......:...+
 +
          +    `  .    :  .  '  +                                          +  `  .  :    .  '    +
 +
          +..........:.*.:........+                                            +........:.*.:..........+
 +
        +    .  '  :  `  .    +                                            +    .  '  :  `  .    +
 +
        +...:.........:.........:+                                              +:.........:.........:...+
 +
      +  `  .    :    .  ' +                                              + `  .    :    .  '  +
 +
      +...........:.*..:........+                                                +........:..*.:...........+
 +
    +      .  '  :  `  .    +                                                +    .  '  :  `  .      +
 +
    +...:.........:..........:.+                                                  +.:..........:.........:...+
 +
  +    `  .    :      .  ' +                                                    + `  .      :    .  '    +
 +
  +            ` *  - '      +                                                      +      ` -  * '            +
 +
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 +
 +
</pre>

Revision as of 20:21, 13 October 2016


bpuI laccase codon optimized for E. coli

bpuI codon optimized from Bacilus pumillus

Sequence and Features


Assembly Compatibility:
  • 10
    INCOMPATIBLE WITH RFC[10]
    Illegal PstI site found at 888
  • 12
    INCOMPATIBLE WITH RFC[12]
    Illegal PstI site found at 888
  • 21
    COMPATIBLE WITH RFC[21]
  • 23
    INCOMPATIBLE WITH RFC[23]
    Illegal PstI site found at 888
  • 25
    INCOMPATIBLE WITH RFC[25]
    Illegal PstI site found at 888
    Illegal AgeI site found at 52
    Illegal AgeI site found at 247
  • 1000
    COMPATIBLE WITH RFC[1000]


bpuI


                                                          .
                                                         1
                                                         1
                                                         1
                                                         M
                                                         M
                                                         M
                                                         M
                                                        \M/
                                                     . ' M ` .
                                                   \##-#####-##/
                                                    \# ##### #/
                                                  ###############
                                                  ###############
                                                   \ ! ! ! ! ! /
                                                    )! ! ! ! !(
                                                    +---------+
                                                    +! ! ! ! !+
                                                    +----*----+
                                                   +`. .':`. .'+
                                                   + .^. : .^. +
                                                   +:...:*:...:+
                                                   +`. .':`. .'+
                                                   + .^. : .^. +
                                                   +:...:*:...:+
                                                   +`. .':`. .'+
                                                   +. ^. : .^ .+
                                                  +:....:*:....:+
                                                  +` .  ':`  . '+
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